Aquest vaixell es va enfonsar el darrer quart del s. I aC, prop de les illes que li donen nom, al litoral del Baix Empordà, a gairebé a 50 metres de fons.
El grau d’espoli que ha patit la nostra costa des dels anys seixanta fa que esdevingui un jaciment excepcional, ja que conserva no només el contenidor (la fusta del vaixell), sinó també el contingut (el carregament d’àmfores). Ara bé, si no s’hi actua està en risc la seva preservació. El hàndicap de la seva excavació és l’elevada fondària a la qual es troba, que tot i que n’ha afavorit la conservació, complica el treball científic en el jaciment.
El carregament del vaixell està conformat per salaons i salses de peix procedents de la Bètica transportats en àmfores Dressel 7, Dressel 10 i Dressel 12. La conservació tant dels contenidors com dels continguts és excepcional, així com la mateixa estructura del buc del vaixell.
L’excavació del derelicte Illes Formigues II s’emmarca en el projecte quadriennal de recerca arqueològica “El derelicte Illes Formigues II i el comerç de productes bètics al nord-est peninsular” liderat pel Centre d’Arqueologia Subaquàtica de Catalunya (CASC), unitat de recerca del Museu d’Arqueologia de Catalunya (MAC).